53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2434 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  77.46 
 
 		 269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  75.41 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  62.86 
 
 		 270 aa  337  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  58.37 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  55.12 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  56.85 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  57.26 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  56.15 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  56.85 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  54.65 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  55.12 
 
 		 273 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  52.31 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  49.43 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  47.04 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  45.15 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  47.52 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  44.94 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  43.45 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  43.46 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  41.35 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  39.66 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  36.86 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  39.34 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  42.33 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  34.44 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.75 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  26.14 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.48 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  25.75 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  26.33 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  30.33 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  26.52 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.38 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  29.17 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  25.86 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  26.25 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  26.43 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  31.5 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  26.05 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  29.33 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  25 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  33.11 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.9 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.9 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  24.3 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.75 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  28.75 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  26.48 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  28.16 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  28.16 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  22.33 
 
 		 484 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  26.85 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>