More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2007 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  67.72 
 
 
255 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  65.99 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  65.18 
 
 
267 aa  351  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  65.18 
 
 
267 aa  351  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  63.45 
 
 
253 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  61.54 
 
 
252 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  62.55 
 
 
253 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  61.85 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.41 
 
 
276 aa  334  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  59.04 
 
 
256 aa  322  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  47.72 
 
 
265 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  45.8 
 
 
259 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  38.65 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 
302 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.71 
 
 
611 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  34.72 
 
 
306 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  33.04 
 
 
304 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
597 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
304 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.95 
 
 
474 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 
548 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
304 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.91 
 
 
466 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  35.43 
 
 
449 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.06 
 
 
258 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  31.91 
 
 
250 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.91 
 
 
463 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 
574 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  31.93 
 
 
304 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  35.06 
 
 
421 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  31.94 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.25 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  32.2 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 
417 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.37 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 
301 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  31.8 
 
 
304 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
519 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.88 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  32.05 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.94 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.18 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 
394 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 
257 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.11 
 
 
238 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.55 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.16 
 
 
239 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
477 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  31.12 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 
472 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  35.18 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.82 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  34.7 
 
 
505 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.22 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 
389 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.22 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  30.93 
 
 
249 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.38 
 
 
299 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.6 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  30.96 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  28.38 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  32.23 
 
 
300 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 
386 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  30.71 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 
462 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  33.02 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  31.87 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.18 
 
 
558 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 
567 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  29.44 
 
 
325 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 
426 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 
256 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.49 
 
 
241 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.96 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  26.58 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  30.8 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 
540 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 
443 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  32.2 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0342003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 
416 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  31.12 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  30.74 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
304 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>