More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1074 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 243 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  80.32 
 
 		 250 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  78.51 
 
 		 242 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  76.52 
 
 		 267 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  76.42 
 
 		 241 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  79.46 
 
 		 243 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  76.42 
 
 		 241 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  78.76 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  76.99 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  74.25 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  74.34 
 
 		 243 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  71.81 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  73.52 
 
 		 247 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  74.09 
 
 		 241 aa  347  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  64.47 
 
 		 243 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  56.56 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  56.56 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  56.05 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  55.61 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  53.81 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  52.47 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  50.45 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  40.68 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  41.98 
 
 		 189 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  36.93 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  41.98 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  40.8 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  38.51 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  32.99 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  34.78 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  33.89 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  38.46 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  37.89 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  34.62 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  37.89 
 
 		 200 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  34.95 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  36.31 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  38.04 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  31.55 
 
 		 188 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  38.27 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  34.27 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  39.26 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  34.64 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  38.71 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  41.98 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  32.98 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  37.65 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  36.59 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  40.37 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  32.28 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  34.41 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  34.46 
 
 		 192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  34.38 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  35.29 
 
 		 190 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  41.98 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  37.97 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  36.72 
 
 		 193 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  39.88 
 
 		 209 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  34.73 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  34.73 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  34.73 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  34.95 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  36.69 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  33.52 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  38.89 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  32.97 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  34.12 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  37.65 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  35.8 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  38.65 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>