More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0114 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 619 aa  1228    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  54.94 
 
 		 623 aa  685    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  54.43 
 
 		 624 aa  660    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  58.74 
 
 		 616 aa  733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  43.71 
 
 		 658 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  43.57 
 
 		 637 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  33.64 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  31.04 
 
 		 657 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  32.59 
 
 		 635 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  32.13 
 
 		 616 aa  303  9e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.6 
 
 		 571 aa  296  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  33.85 
 
 		 662 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  32.62 
 
 		 665 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  32.57 
 
 		 663 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  31.8 
 
 		 576 aa  283  9e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  31.86 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  29.67 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 		 657 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  31.24 
 
 		 576 aa  277  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 		 663 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  30.62 
 
 		 607 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  31.09 
 
 		 576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  30.08 
 
 		 664 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  32.79 
 
 		 688 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  32.13 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  32.59 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  32.49 
 
 		 688 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.75 
 
 		 680 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.2 
 
 		 688 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  30.49 
 
 		 689 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.12 
 
 		 649 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  31.39 
 
 		 663 aa  263  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30 
 
 		 646 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  30.96 
 
 		 607 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  31.12 
 
 		 650 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.68 
 
 		 647 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  28.99 
 
 		 647 aa  257  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  29.78 
 
 		 676 aa  256  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  29.6 
 
 		 654 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  31.45 
 
 		 610 aa  256  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 		 784 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  28.68 
 
 		 620 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  30.93 
 
 		 661 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  30.2 
 
 		 665 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  30.25 
 
 		 691 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 		 645 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  28.92 
 
 		 647 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  28.83 
 
 		 680 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  249  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  28.13 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  30.08 
 
 		 631 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  28.55 
 
 		 606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 778 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  31.26 
 
 		 659 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  30.99 
 
 		 676 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  28.71 
 
 		 848 aa  243  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  30.37 
 
 		 654 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  29.34 
 
 		 708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 		 631 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  27.63 
 
 		 666 aa  240  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 		 697 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  29.3 
 
 		 645 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 		 606 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  27.88 
 
 		 664 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  27.75 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  29.75 
 
 		 712 aa  234  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  28.85 
 
 		 669 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  30.17 
 
 		 668 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 		 666 aa  233  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.85 
 
 		 649 aa  232  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.06 
 
 		 662 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  30.27 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  29.28 
 
 		 634 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  29.36 
 
 		 715 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.02 
 
 		 713 aa  230  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  30.71 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.98 
 
 		 662 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 774 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  27.26 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  28 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  26.9 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 		 662 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  28.42 
 
 		 764 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  26.41 
 
 		 669 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.65 
 
 		 662 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  29.86 
 
 		 595 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.17 
 
 		 662 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.62 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  27.62 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.62 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  30.52 
 
 		 776 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  31.58 
 
 		 738 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  30.05 
 
 		 764 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  27.33 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  26.56 
 
 		 669 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 		 764 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  29.3 
 
 		 747 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  31.96 
 
 		 766 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>