32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7553 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 131 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  94.66 
 
 		 131 aa  200  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  69.11 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  69.11 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  69.11 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  69.29 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  58.14 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  41.46 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  39.37 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  38.71 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.08 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.63 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.88 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  31.34 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.75 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  27.42 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.9 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  30.23 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.95 
 
 		 139 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  39.34 
 
 		 133 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>