41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5937 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5937  phasin  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  88.62 
 
 		 123 aa  222  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  47.62 
 
 		 162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  47.54 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  46.72 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  49.14 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  46.83 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  46.83 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  47.5 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  44.55 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  41.23 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  40.17 
 
 		 117 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  38.79 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  38.79 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  41.07 
 
 		 210 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  36.44 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  39.45 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  41.82 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  38.79 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  34.23 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  37.62 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  37.25 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  33.04 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  34.23 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  31.25 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  33.62 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  32.26 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  31.25 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  31.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  29.03 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  31.25 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  31.3 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  28.83 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  26.04 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  28.87 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  26.4 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  28.12 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>