More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4139 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  78.84 
 
 		 479 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  78.84 
 
 		 479 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  78.84 
 
 		 479 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  75.1 
 
 		 481 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  90.66 
 
 		 482 aa  833    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 		 482 aa  936    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  61.76 
 
 		 476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  62 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  61.52 
 
 		 478 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.87 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  62.77 
 
 		 478 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  60.13 
 
 		 477 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  60 
 
 		 478 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  61.06 
 
 		 478 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  62.55 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.44 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  61.72 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  58.21 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  59.28 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  57.14 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  57.14 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  56.55 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  56.96 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  60 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  58 
 
 		 478 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  51.9 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  57.44 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  50.88 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  54.37 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  53.68 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.36 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  50.32 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  52.35 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.68 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  49.3 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  50.34 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  50.75 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  50.75 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.22 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  52.57 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.12 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2819  NADH dehydrogenase subunit N  47.32 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  41.85 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  38.22 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  41.63 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.97 
 
 		 487 aa  342  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.66 
 
 		 484 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.01 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.25 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.44 
 
 		 484 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  41.39 
 
 		 484 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  41.31 
 
 		 489 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  43.28 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  42.58 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.58 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 		 490 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  43.51 
 
 		 490 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.99 
 
 		 479 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 		 489 aa  319  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  41.57 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  42.27 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  41.57 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  41.94 
 
 		 488 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  41.57 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.76 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  41.71 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  39.22 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  41.55 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  39.82 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  39.55 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  40.9 
 
 		 491 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  39.34 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  38.66 
 
 		 480 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.95 
 
 		 488 aa  302  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.89 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  38.38 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  40.37 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 		 487 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.06 
 
 		 476 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  38 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.5 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  37.37 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.08 
 
 		 516 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2581  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.08 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0861426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1267  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.08 
 
 		 516 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.79 
 
 		 511 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.84 
 
 		 518 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.2 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  41.39 
 
 		 491 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.9 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.9 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  41.73 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>