More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0398 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  95.63 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  90.78 
 
 		 206 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  90.29 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  90.78 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  86.41 
 
 		 206 aa  358  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  78.64 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  75.73 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  60 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.05 
 
 		 231 aa  237  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.57 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.62 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.96 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.81 
 
 		 231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.85 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  53.81 
 
 		 231 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.67 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  53.77 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  50.99 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.42 
 
 		 248 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.25 
 
 		 257 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  47.21 
 
 		 833 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  49.76 
 
 		 247 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  45.18 
 
 		 836 aa  171  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  44.34 
 
 		 878 aa  169  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  167  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  81 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  80 
 
 		 100 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  79 
 
 		 100 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  80 
 
 		 100 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  85 
 
 		 100 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  79 
 
 		 103 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  80 
 
 		 100 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  77 
 
 		 100 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  42.74 
 
 		 840 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  76 
 
 		 100 aa  160  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  52.61 
 
 		 234 aa  157  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  76 
 
 		 100 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  51.87 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  78 
 
 		 100 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.59 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.69 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.74 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  75.76 
 
 		 100 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.81 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  70 
 
 		 101 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  70 
 
 		 101 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  70 
 
 		 101 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  70 
 
 		 104 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  68 
 
 		 101 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  68 
 
 		 101 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  83.72 
 
 		 86 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  74.75 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  68.69 
 
 		 101 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  67 
 
 		 101 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  68 
 
 		 104 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  70.3 
 
 		 101 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  69 
 
 		 100 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  66 
 
 		 101 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  66 
 
 		 101 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  67 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  62 
 
 		 100 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 100 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  63 
 
 		 101 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>