22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3866 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  60 
 
 
265 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  40.97 
 
 
354 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  44.63 
 
 
296 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  43.73 
 
 
267 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  42.5 
 
 
310 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  41.35 
 
 
290 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  41.47 
 
 
287 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  45.18 
 
 
287 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  42.65 
 
 
276 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  38.31 
 
 
226 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  38.36 
 
 
267 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  38.55 
 
 
263 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  38.26 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  40.15 
 
 
257 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  38.17 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  51.74 
 
 
173 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  44.21 
 
 
189 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  45.57 
 
 
108 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  43.75 
 
 
97 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  51.28 
 
 
101 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>