45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3783 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  680    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  40.65 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  39.34 
 
 
371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  37.64 
 
 
300 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  40.78 
 
 
255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  36.13 
 
 
296 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  32.86 
 
 
290 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  33.81 
 
 
288 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  33.21 
 
 
293 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  36.72 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  28.93 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  32.39 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  31.98 
 
 
349 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  33.18 
 
 
321 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 
312 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  29.56 
 
 
348 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  27.21 
 
 
292 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  26.64 
 
 
356 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  28.68 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  30.34 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  32.3 
 
 
358 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  29.77 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  26.82 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  24.6 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  28.11 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  24.9 
 
 
1320 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  27.83 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  27.78 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  23.59 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  24.1 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  29.94 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.78 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  25.21 
 
 
226 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25.9 
 
 
211 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.12 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  24.05 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  29.03 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  31.82 
 
 
203 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  26.56 
 
 
211 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  22.7 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  28.23 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  28.23 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>