More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3266 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  100 
 
 
307 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  34.93 
 
 
330 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  35.42 
 
 
272 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  31.97 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.44 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.04 
 
 
285 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.58 
 
 
272 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.58 
 
 
272 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.58 
 
 
272 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.94 
 
 
271 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  28.28 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.82 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  29.8 
 
 
278 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  33.33 
 
 
301 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  30.1 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  29.21 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.09 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.05 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  27.94 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  30.04 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  28.46 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.22 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  27.47 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  27.84 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.22 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  28.21 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  28.57 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.52 
 
 
285 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  28.21 
 
 
323 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  28.21 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  27.47 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.47 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  29.21 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.7 
 
 
279 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  27.11 
 
 
332 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27.27 
 
 
290 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  30.82 
 
 
278 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  25.81 
 
 
332 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  26.37 
 
 
332 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  31.5 
 
 
330 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  26.84 
 
 
323 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  26.33 
 
 
268 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.21 
 
 
319 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.33 
 
 
273 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  26.74 
 
 
333 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28 
 
 
558 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  30.34 
 
 
264 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  27.11 
 
 
332 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  27.94 
 
 
321 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  26.1 
 
 
323 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.52 
 
 
278 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  26.47 
 
 
323 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  27.17 
 
 
319 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  26.62 
 
 
272 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  26.47 
 
 
323 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  26.47 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.26 
 
 
273 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  29.14 
 
 
302 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  27.47 
 
 
323 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  28.86 
 
 
276 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  26.28 
 
 
321 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  27.64 
 
 
320 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
277 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  26.26 
 
 
322 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  31.1 
 
 
270 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  27.68 
 
 
281 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  26.74 
 
 
332 aa  99.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 
460 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  24.18 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  26.89 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  28.47 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  26.87 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  29.45 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  27.36 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.24 
 
 
303 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.73 
 
 
272 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.02 
 
 
281 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.64 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  26.74 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  28.71 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  26.71 
 
 
281 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  28.93 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  25.51 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  26.91 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  27.36 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  29.8 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.57 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  26.43 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  28.57 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  26.43 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  23 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.18 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  26.77 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>