27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2235 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2235  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.294836  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2253  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0483371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 538 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 632 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 4079 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 538 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 502 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 927 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 703 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.06 
 
 		 810 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 804 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1069 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 878 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 722 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 638 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 2262 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 638 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 846 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 		 593 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 417 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 424 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 		 414 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>