203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0220 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  100 
 
 
363 aa  747    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  60.17 
 
 
371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  59.94 
 
 
372 aa  414  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  56.23 
 
 
399 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  57.1 
 
 
394 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  55.15 
 
 
392 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  56.25 
 
 
387 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  57.94 
 
 
387 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  52.6 
 
 
399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  52.02 
 
 
398 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  51.3 
 
 
405 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  52.6 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  51.6 
 
 
398 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  52.77 
 
 
394 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  52.77 
 
 
394 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  52.77 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  51.9 
 
 
394 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  52.19 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  52.12 
 
 
394 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  48.45 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  50.57 
 
 
402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  48.17 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  37.76 
 
 
349 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  37.61 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  37.94 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  37.61 
 
 
349 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  37.46 
 
 
349 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  37.61 
 
 
349 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  37.31 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  37.31 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  37.17 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  37.03 
 
 
349 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  36.87 
 
 
349 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  39.17 
 
 
343 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  39.17 
 
 
343 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  35.29 
 
 
345 aa  235  8e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  37.87 
 
 
340 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  34.02 
 
 
344 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  34.03 
 
 
343 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  36.23 
 
 
363 aa  211  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  35.76 
 
 
342 aa  202  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  36.95 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  35.29 
 
 
357 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  28.31 
 
 
353 aa  124  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  24.84 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  24.71 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  26.89 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  27.92 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  24.79 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  26.69 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  26.3 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  26.77 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  23.63 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  24.06 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  26.67 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  27.66 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  25 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  23.28 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  26.03 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  25.78 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  26.32 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  25.78 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  35.8 
 
 
86 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  26.65 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  25.39 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  25.39 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  25.39 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  25.39 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  25.39 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  26.09 
 
 
355 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  26.43 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  23.64 
 
 
351 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  27.84 
 
 
356 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  26.51 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.12 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  27.09 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  23.26 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  25.71 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  23.39 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  27.01 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.5 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.5 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  25.38 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  27.5 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  27.5 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.5 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  26.62 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  27.5 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0428  peptidase, M42 family  25.39 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  24.39 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  24.9 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4808  peptidase, M42 family  25.39 
 
 
357 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  25.81 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  26.77 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  25.11 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  25.11 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  23.29 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  28.75 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  25.35 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  24.65 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>