40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1043 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  92.72 
 
 
302 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  89.4 
 
 
302 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  72.85 
 
 
302 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  47.33 
 
 
311 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  31.91 
 
 
307 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  29.24 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  27.1 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  28.86 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  26.76 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  27.49 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  27.8 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  25.98 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  22.22 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  23.39 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  22.36 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  27.18 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  25.24 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  22.05 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  27.05 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  19.69 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  21.45 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  36.04 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  30.21 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  37.19 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  36.59 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  28.28 
 
 
357 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  26.23 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  28 
 
 
357 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  24 
 
 
360 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  28.39 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  24.62 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  28.85 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  21.6 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  35.34 
 
 
414 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  25.24 
 
 
357 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  24.53 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  22.22 
 
 
374 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>