72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0252 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0252  transposase  100 
 
 
73 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000199442  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  80.7 
 
 
232 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  77.19 
 
 
231 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  71.93 
 
 
231 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  75 
 
 
238 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  75 
 
 
238 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  75 
 
 
238 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  69.64 
 
 
238 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  70.37 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1447  transposase  58.33 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149783  normal  0.684371 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  64.1 
 
 
238 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  51.85 
 
 
238 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  61.54 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  58.97 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  58.97 
 
 
238 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  47.92 
 
 
94 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  61.54 
 
 
238 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  50 
 
 
238 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  58.97 
 
 
238 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  45.16 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  45.16 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  45.16 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  56.41 
 
 
232 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  46 
 
 
236 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  45.83 
 
 
233 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  48.78 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  57.5 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  56.41 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  53.49 
 
 
233 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  50 
 
 
237 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  48.72 
 
 
233 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  45.45 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  40.43 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  40.35 
 
 
237 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  42.86 
 
 
235 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  51.06 
 
 
237 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  46.15 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  46.15 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  46.15 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  46.15 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  46.15 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  36.73 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  48.94 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  43.75 
 
 
233 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  43.75 
 
 
233 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  51.06 
 
 
236 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  43.75 
 
 
233 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  43.75 
 
 
233 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  48.94 
 
 
237 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  38.78 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  48.94 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  51.16 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  38.6 
 
 
251 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  48.94 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  38.78 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  41.67 
 
 
263 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  40.74 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  40 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4777  putative transposase  40.43 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  38.46 
 
 
228 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  36 
 
 
222 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>