34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2154 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  40.76 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  39.87 
 
 		 146 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  37.16 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  40.27 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  37.41 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  32.87 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  28.86 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  48.28 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.23 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  28.57 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  28.57 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.65 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  28.57 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  28.97 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  30.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  31.34 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  31.34 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  25.48 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  38.98 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  27.03 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  33.12 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  37.93 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  44.23 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  29.01 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  28.97 
 
 		 140 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44.44 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>