31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5432 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  560  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  98.06 
 
 
309 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  98.06 
 
 
309 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  54.25 
 
 
307 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  53.87 
 
 
297 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  41.03 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  34.75 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  36.14 
 
 
739 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.82 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  34.48 
 
 
400 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  36.36 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  35.51 
 
 
681 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  30.08 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  41.3 
 
 
672 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.16 
 
 
551 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.09 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1741  copper resistance D  37.82 
 
 
550 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.25 
 
 
664 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  37.41 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.61 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.43 
 
 
588 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  30.74 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 
613 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  48.33 
 
 
676 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  32.13 
 
 
722 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  33.62 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  32.99 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  35.9 
 
 
678 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.14 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  28.42 
 
 
304 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  34.95 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>