37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2224 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  326  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  48.41 
 
 
1051 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  46.15 
 
 
1041 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  41.94 
 
 
1073 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  37.7 
 
 
1087 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  37.82 
 
 
1033 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  33.9 
 
 
984 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  34.33 
 
 
1035 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  36.89 
 
 
1039 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  35.04 
 
 
1052 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  38.66 
 
 
1006 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  34.88 
 
 
1081 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  39.17 
 
 
1027 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  37.93 
 
 
1029 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  37.93 
 
 
1022 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  34.62 
 
 
1039 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  31.36 
 
 
989 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  34.4 
 
 
1102 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  33.33 
 
 
1067 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  31.78 
 
 
1112 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  35.83 
 
 
1078 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  32.48 
 
 
1063 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  32.76 
 
 
1059 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  29.27 
 
 
1069 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  28.81 
 
 
1060 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  28.33 
 
 
1000 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  28.08 
 
 
1035 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  34.45 
 
 
985 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 
1012 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  35.09 
 
 
1009 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  30.51 
 
 
1008 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  32.77 
 
 
1004 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  28.45 
 
 
1067 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  34.82 
 
 
1142 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2046  hypothetical protein  53.85 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156175  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 
1010 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  31.39 
 
 
1007 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>