36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1876 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  98.48 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  98.48 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  62.69 
 
 		 261 aa  317  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  35.32 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.07 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  29.62 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  30.86 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.13 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.05 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  30.06 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.42 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  31.71 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  27.37 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.61 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  26.82 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  26.82 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  26.82 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  26.82 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.54 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 394 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.63 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.93 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.17 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.28 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>