22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2476 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  79.08 
 
 
153 aa  254  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  77.12 
 
 
153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  73.68 
 
 
153 aa  238  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  70.67 
 
 
154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  69.59 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  64.24 
 
 
154 aa  206  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  64.29 
 
 
156 aa  201  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  64.29 
 
 
156 aa  201  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  63.64 
 
 
156 aa  200  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  62.99 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  64 
 
 
161 aa  186  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  61.18 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  47.97 
 
 
156 aa  137  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  47.33 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  42.57 
 
 
152 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  40.54 
 
 
152 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  40.54 
 
 
152 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  39.86 
 
 
152 aa  100  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1531  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.76 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0845  riboflavin synthase  36 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0830  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.24 
 
 
157 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00102781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>