28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1291 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  100 
 
 
2353 aa  4161    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  47.86 
 
 
625 aa  132  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.14 
 
 
830 aa  112  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  20.98 
 
 
1068 aa  100  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  45.37 
 
 
605 aa  94.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  20.34 
 
 
1012 aa  84  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  20.9 
 
 
962 aa  83.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  46.88 
 
 
1394 aa  74.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.11 
 
 
2313 aa  72.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  51.8 
 
 
453 aa  70.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 
778 aa  70.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  34.45 
 
 
329 aa  64.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6042  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.57 
 
 
228 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3509  hypothetical protein  35.64 
 
 
618 aa  57.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169849  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  31.76 
 
 
354 aa  55.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  24.22 
 
 
16322 aa  52.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  27.7 
 
 
1266 aa  52.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  27.42 
 
 
1311 aa  52.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  27.42 
 
 
1311 aa  52.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  36.82 
 
 
671 aa  51.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  32.21 
 
 
687 aa  51.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0435  ftsk/spoiiie family protein  26 
 
 
1356 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.099087  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  36.19 
 
 
521 aa  50.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  24.46 
 
 
522 aa  49.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  41.51 
 
 
258 aa  48.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  37.7 
 
 
561 aa  48.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 
445 aa  48.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  62.9 
 
 
203 aa  47  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>