26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0927 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.21 
 
 		 171 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.33 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  56.58 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  55.13 
 
 		 157 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.47 
 
 		 163 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.21 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  53.29 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  52.94 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  50.45 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  54.84 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  53.19 
 
 		 119 aa  104  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  47.27 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  47.17 
 
 		 111 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  45.54 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  39.53 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  45.07 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  39.19 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  37.08 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  38.36 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  38.82 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  39.44 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  34.09 
 
 		 582 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.28 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>