30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4788 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  69.39 
 
 
147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  52.21 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  52.21 
 
 
141 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  52.21 
 
 
141 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
155 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
148 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
148 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
148 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  34.23 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  28.7 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.09 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.11 
 
 
128 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  29.55 
 
 
128 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.971346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>