More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4376 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  100 
 
 
710 aa  1393    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  57.04 
 
 
709 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  57.04 
 
 
709 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  53.78 
 
 
715 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  57.04 
 
 
709 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  54.92 
 
 
726 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  48.47 
 
 
730 aa  598  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  47.1 
 
 
711 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  35.16 
 
 
770 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  33.19 
 
 
771 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  42.37 
 
 
817 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  33.68 
 
 
762 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.6 
 
 
371 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.57 
 
 
674 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.28 
 
 
370 aa  164  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  28.8 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.81 
 
 
387 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  31.7 
 
 
351 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  25.86 
 
 
1006 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  25.54 
 
 
989 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.41 
 
 
684 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  24.04 
 
 
672 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  27.38 
 
 
968 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  31.36 
 
 
343 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  26.42 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.02 
 
 
267 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.4 
 
 
267 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  31.41 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  28.18 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  28.92 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.4 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.11 
 
 
265 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  27.5 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  32.43 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  26.21 
 
 
343 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  31.69 
 
 
287 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  31.65 
 
 
380 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.33 
 
 
274 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  35.81 
 
 
336 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  26.76 
 
 
343 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 
275 aa  64.3  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  33.12 
 
 
302 aa  64.3  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41002  predicted protein  38.46 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.75 
 
 
378 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  25.68 
 
 
343 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04809  molybdopterin biosynthesis protein  35.85 
 
 
276 aa  63.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.67 
 
 
251 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.96 
 
 
203 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
247 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.3 
 
 
240 aa  60.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.08 
 
 
354 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  31.58 
 
 
349 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.3 
 
 
199 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  30.11 
 
 
315 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.21 
 
 
320 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.45 
 
 
255 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.86 
 
 
215 aa  60.1  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  28.18 
 
 
249 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  28.3 
 
 
290 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.3 
 
 
199 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  28.57 
 
 
272 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 
443 aa  58.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.92 
 
 
263 aa  58.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.64 
 
 
287 aa  58.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.45 
 
 
403 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  28.67 
 
 
382 aa  57.4  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  30.92 
 
 
268 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.86 
 
 
355 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.09 
 
 
219 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.81 
 
 
253 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.05 
 
 
207 aa  57  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  33.85 
 
 
300 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  28.95 
 
 
273 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  29.86 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  29.22 
 
 
252 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.08 
 
 
255 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  29.41 
 
 
335 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.22 
 
 
262 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.22 
 
 
256 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  30.92 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  30.26 
 
 
268 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  30.26 
 
 
268 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.61 
 
 
239 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  30.26 
 
 
268 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  36.04 
 
 
291 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  26.82 
 
 
342 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>