21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1613 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  60.61 
 
 
199 aa  262  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  59.8 
 
 
199 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  58.59 
 
 
199 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  41.04 
 
 
680 aa  147  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  41.18 
 
 
668 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  38.1 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  31.43 
 
 
332 aa  87.8  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  32.91 
 
 
367 aa  85.1  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.58 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  30.95 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  27.91 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  25.15 
 
 
262 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.91 
 
 
278 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  26.35 
 
 
273 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  26.63 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  26.01 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  32.98 
 
 
351 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  21.47 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  22.03 
 
 
437 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  25.93 
 
 
576 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>