38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0858 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  92.86 
 
 
252 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  90.87 
 
 
252 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  90.87 
 
 
252 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  73.81 
 
 
252 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  53.41 
 
 
278 aa  249  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  51.79 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
248 aa  242  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 
250 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
250 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  49.41 
 
 
251 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
247 aa  234  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  50.2 
 
 
247 aa  227  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 
249 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  46.03 
 
 
248 aa  223  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  48.02 
 
 
249 aa  221  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  49.21 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 
278 aa  219  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  48.8 
 
 
253 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
284 aa  217  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  48.61 
 
 
247 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 
281 aa  217  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.2 
 
 
267 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  45.45 
 
 
263 aa  193  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  40.64 
 
 
254 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  40.08 
 
 
271 aa  158  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  35.69 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  37.24 
 
 
363 aa  135  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  34.12 
 
 
397 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  35.18 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  34.36 
 
 
372 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  33.07 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  31.71 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  28.57 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0339  50S ribosomal protein L4  25.67 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198449  decreased coverage  0.000274158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  29.75 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>