24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0261 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  97.83 
 
 
333 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0261  putative integrase/recombinase  100 
 
 
46 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  62.79 
 
 
323 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  46.67 
 
 
324 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  51.16 
 
 
322 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  51.16 
 
 
324 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  51.16 
 
 
322 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  48.84 
 
 
340 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  48.84 
 
 
340 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  51.16 
 
 
321 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  44.19 
 
 
328 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  48.84 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  48.84 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  48.84 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  44.19 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  46.51 
 
 
322 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  40.43 
 
 
309 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  41.3 
 
 
291 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  45.65 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  62.96 
 
 
336 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  45.83 
 
 
390 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  44.44 
 
 
334 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  48.39 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  45 
 
 
325 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>