39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1107 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  64.66 
 
 
248 aa  308  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  42.17 
 
 
247 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  39.76 
 
 
247 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  39.06 
 
 
231 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  39.06 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  39.06 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  38.63 
 
 
231 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  37.55 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  38.2 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  39.68 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  41.3 
 
 
244 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  39.92 
 
 
246 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  39.27 
 
 
245 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  36.29 
 
 
232 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  35.37 
 
 
239 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  35.62 
 
 
230 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  33.47 
 
 
239 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.03 
 
 
544 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  34.62 
 
 
237 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  29.44 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  48.54 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  25.91 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.7 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.01 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  26.83 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  23.28 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  23.73 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  31.28 
 
 
492 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  28.47 
 
 
342 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  28.57 
 
 
70 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  26.32 
 
 
484 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  26.75 
 
 
396 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  27.89 
 
 
400 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  25.94 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  28.57 
 
 
439 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>