20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0243 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  423  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  58.86 
 
 
239 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  47.24 
 
 
237 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  37.2 
 
 
234 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  37.57 
 
 
264 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  42.67 
 
 
227 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  38.12 
 
 
264 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  42.76 
 
 
227 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  38.65 
 
 
202 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  39.35 
 
 
202 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  38.36 
 
 
236 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  35.95 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  39.19 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  31.67 
 
 
989 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  32.14 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  36.28 
 
 
311 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  38.3 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  38.3 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  38.3 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  38.3 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>