19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2741 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  100 
 
 		 333 aa  666    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  58.97 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  30.87 
 
 		 415 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 717 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 426 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  26.83 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  25.78 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 506 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 735 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 426 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 426 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 426 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  35.8 
 
 		 620 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 832 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>