More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2252 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
414 aa  782    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  56.4 
 
 
497 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  52.55 
 
 
487 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  54.86 
 
 
486 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  53.83 
 
 
509 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  55.47 
 
 
483 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  56.81 
 
 
499 aa  357  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  54.78 
 
 
486 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  45.45 
 
 
481 aa  343  5e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  48.39 
 
 
485 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  43.72 
 
 
478 aa  332  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  49.36 
 
 
485 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  42.14 
 
 
477 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  58.6 
 
 
411 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  51.15 
 
 
573 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  49.13 
 
 
574 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  45.48 
 
 
445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  49.88 
 
 
575 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  46 
 
 
576 aa  302  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  49.87 
 
 
572 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  46.9 
 
 
581 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  42.68 
 
 
506 aa  295  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  47.15 
 
 
580 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.15 
 
 
598 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  45.01 
 
 
588 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  49.61 
 
 
578 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  45.83 
 
 
605 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  47.26 
 
 
575 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  47.26 
 
 
575 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  49.25 
 
 
569 aa  285  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  45.52 
 
 
581 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  45.25 
 
 
597 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  45.62 
 
 
577 aa  282  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  49.37 
 
 
580 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  44.75 
 
 
576 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  49.37 
 
 
580 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  44.75 
 
 
576 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  44.75 
 
 
576 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  48 
 
 
572 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  44.75 
 
 
576 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  48.87 
 
 
580 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  47.37 
 
 
582 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  45.5 
 
 
573 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  48.83 
 
 
580 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  46.88 
 
 
580 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  48.87 
 
 
580 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  45.25 
 
 
574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  46.83 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  46.75 
 
 
574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  46.25 
 
 
574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  48.49 
 
 
598 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  45.19 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  46.87 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  45.19 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  46.25 
 
 
574 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  46.25 
 
 
574 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  45.19 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  45.19 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  46.5 
 
 
574 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  44.94 
 
 
577 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  43.78 
 
 
608 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  40.3 
 
 
498 aa  269  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 
570 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  46.56 
 
 
610 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  41.54 
 
 
626 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 
593 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  46.96 
 
 
541 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  43.99 
 
 
624 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  43.48 
 
 
624 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  43.61 
 
 
598 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  42.78 
 
 
597 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  42.86 
 
 
596 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  47.77 
 
 
500 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  48.68 
 
 
490 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  48.44 
 
 
490 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  43.94 
 
 
505 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  44.96 
 
 
498 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  42.33 
 
 
597 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  42.12 
 
 
596 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  48.44 
 
 
490 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  46.15 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  46.43 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  46.43 
 
 
578 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  46.43 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  46.15 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  46.15 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  46.15 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  46.43 
 
 
578 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 
496 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  42.08 
 
 
597 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  48.48 
 
 
538 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  42.08 
 
 
597 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  42.3 
 
 
597 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  43.72 
 
 
616 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  44.76 
 
 
490 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  43 
 
 
590 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  44.74 
 
 
592 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  44.65 
 
 
498 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>