28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0273 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  59.46 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  51.88 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  47.37 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  43.92 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  39.19 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  38.51 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  40.79 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  42.57 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  42.19 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  34.67 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  34.42 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  37.31 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  28.48 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  34.59 
 
 		 211 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  33.97 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08253  proteasome maturation ans ribosome synthesis protein Nop10, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04000)  40.62 
 
 		 431 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  38.95 
 
 		 481 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04300  art-4 protein, putative  37.23 
 
 		 494 aa  51.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  32.77 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  36.21 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.191638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>