25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2126 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  96.25 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  84.23 
 
 		 231 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  47.98 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  53.33 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  46.43 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  36.84 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  40.96 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  40.48 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  67.69 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  42.17 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  42.86 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  50.72 
 
 		 460 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  41.67 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  45.33 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  42.86 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  30.15 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  27.2 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  39.29 
 
 		 386 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  39.29 
 
 		 388 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1022  hypothetical protein  35.71 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  50 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  50 
 
 		 321 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  36.78 
 
 		 404 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  36.78 
 
 		 375 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>