23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1793 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  97.14 
 
 		 455 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  94.07 
 
 		 455 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 455 aa  863    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  38.41 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  40.95 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.68 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  39.91 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  38.58 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.2 
 
 		 481 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  36.05 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  36.81 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.84 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  41.05 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.03 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  37.25 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  37.35 
 
 		 415 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  34.77 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  33.55 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  37.61 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.69 
 
 		 1059 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  33.33 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1468  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0038346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1439  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>