28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0537 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  73.03 
 
 
473 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  969    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  71 
 
 
473 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  73.03 
 
 
473 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  59.44 
 
 
463 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  41.26 
 
 
440 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  41.02 
 
 
439 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  30.1 
 
 
494 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  29.54 
 
 
407 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  27.76 
 
 
409 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  28.47 
 
 
418 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  28.06 
 
 
390 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  26.71 
 
 
418 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  27.66 
 
 
427 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  26.53 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  27.4 
 
 
439 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  25.06 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  23.33 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  23.62 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  25.6 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.62 
 
 
477 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  31.01 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  25.58 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  30.08 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  40.74 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  43.14 
 
 
464 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  38.33 
 
 
456 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  24.3 
 
 
407 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>