41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0095 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  233  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  86.79 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  58.12 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  54.7 
 
 		 116 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  55.36 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  54.39 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  56.14 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  52.14 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  53.51 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  44.35 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  53.85 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  43.7 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  53.51 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  56.25 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  53.91 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  53.91 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  45.95 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  47.75 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  44.74 
 
 		 210 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  42.34 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  42.34 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  42.34 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  39.8 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  38.46 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  31.48 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  36.54 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  35.9 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  32.41 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  37.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  34.62 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  35.19 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  35.19 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  31.43 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  31.68 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  30.69 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  28.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  28.7 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  29.57 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>