92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1300 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1300  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
53 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3413  putative ferredoxin  76 
 
 
53 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.750023  normal  0.917562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 
589 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0517  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 
53 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0471741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  40.74 
 
 
644 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.71796  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.1 
 
 
604 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1172  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.94 
 
 
594 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0282  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 
52 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
421 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0621  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.23 
 
 
392 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1362  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 
52 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.274996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.06 
 
 
593 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  48.94 
 
 
390 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
634 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.68 
 
 
331 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.81 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  44 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0679  ferredoxin  42.31 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.23 
 
 
239 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.537791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 
385 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.18 
 
 
590 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.62 
 
 
306 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.81 
 
 
791 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0807  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.22 
 
 
589 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  43.14 
 
 
639 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.17 
 
 
362 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  34.78 
 
 
434 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  38.78 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.23 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000062189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 
369 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.58 
 
 
623 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.21 
 
 
427 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 
1021 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  42.22 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.78 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.86 
 
 
365 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.43 
 
 
404 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  34.88 
 
 
633 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.69 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
597 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.74 
 
 
432 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1421  ferredoxin, 4Fe-4S  46.15 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.17 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40 
 
 
559 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 
398 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40 
 
 
558 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40 
 
 
559 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.78 
 
 
282 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2146  iron-sulfur cluster-binding protein  33.96 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.471732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.55 
 
 
292 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  41.46 
 
 
634 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2672  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
180 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0219077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 
298 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.58 
 
 
301 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.38 
 
 
289 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  42.31 
 
 
59 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.74 
 
 
432 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.58 
 
 
848 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2757  putative ferredoxin  46.94 
 
 
56 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 
56 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.69 
 
 
371 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  46 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
368 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2442  ferredoxin (fdxA)  46.94 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  37.29 
 
 
446 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  33.33 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
296 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
361 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.82 
 
 
196 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  39.02 
 
 
633 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  36.54 
 
 
320 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1736  ferredoxin, 2(4Fe-4S)  37.74 
 
 
56 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.868501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.86 
 
 
590 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  38.46 
 
 
796 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  38.3 
 
 
291 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  37.04 
 
 
418 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.94 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0881  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.46 
 
 
275 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161363  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
397 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  35.85 
 
 
549 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  38 
 
 
594 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  40.38 
 
 
322 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2882  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
56 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000541835  normal  0.0204566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
395 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1487  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
324 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00133534  hitchhiker  0.0000000109439 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.13 
 
 
301 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>