97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1362 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1362  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
52 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.274996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0282  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.08 
 
 
52 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  88.46 
 
 
52 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.71796  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0621  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.62 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0517  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.92 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0471741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  39.62 
 
 
644 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
589 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.92 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5231  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
543 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0830  putative electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.83 
 
 
280 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214006  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  41.3 
 
 
306 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08380  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, gamma subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family/2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family  46 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.198369  normal  0.196547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.02 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00607284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0881  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.83 
 
 
275 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161363  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0852  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.83 
 
 
280 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.92 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.98 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 
548 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.715541  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1300  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48 
 
 
53 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.9 
 
 
590 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2105  ferredoxin  52.08 
 
 
58 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.17 
 
 
367 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 
421 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  43.75 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1390  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
527 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  45.24 
 
 
796 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4260  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
531 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52 
 
 
58 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.295211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0307  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  44 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.889115  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  46.94 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1097  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.3 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1736  ferredoxin, 2(4Fe-4S)  48.08 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.868501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 
397 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  48 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  43.75 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  48 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  43.75 
 
 
272 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3413  putative ferredoxin  48 
 
 
53 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.750023  normal  0.917562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  49.02 
 
 
482 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.98 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0679  ferredoxin  44 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  46.67 
 
 
384 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  43.75 
 
 
369 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.67 
 
 
604 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.55 
 
 
365 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
398 aa  42  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 
431 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.55 
 
 
306 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  45.65 
 
 
460 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.94 
 
 
95 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.753376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.81 
 
 
357 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0444  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
529 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.81 
 
 
357 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
592 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0570  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42.86 
 
 
87 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.86 
 
 
593 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0069  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
397 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.416863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  48 
 
 
617 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.98 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.83 
 
 
791 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.14 
 
 
397 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46 
 
 
56 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0843  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.463441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  44 
 
 
392 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
383 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.337966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  43.14 
 
 
526 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1037  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.94 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000342317  unclonable  0.00000000788382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.44 
 
 
369 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
597 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1168  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  47.92 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0277209  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
559 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.145659  normal  0.822343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 
395 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  38.3 
 
 
595 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  44.9 
 
 
639 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
1013 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0750  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  47.92 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.165359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.43 
 
 
543 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  41.18 
 
 
421 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 
56 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.22 
 
 
680 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
553 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 
287 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.43 
 
 
371 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
443 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.18 
 
 
67 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255294  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 
273 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1357  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  40.74 
 
 
112 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>