More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2169 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  60.78 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  54.68 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  55.72 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  55.39 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  50.79 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  49 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  47.76 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  46.23 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  41.29 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  40.1 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  43.78 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  41.51 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  38.1 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  37.79 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  37.33 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  37.33 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  33.05 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  37.21 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  33 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  33.17 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  33.33 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  33.68 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  32.97 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  35.62 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.88 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.88 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.62 
 
 		 328 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  32.82 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.43 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.86 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.73 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.73 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.42 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.82 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  37.8 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.35 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.78 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.77 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  53.85 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  39.76 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.91 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.34 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.39 
 
 		 506 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  45.33 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  56 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.69 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  32.76 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  32.76 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.84 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.52 
 
 		 295 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.98 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.91 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.17 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  52.08 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  39.33 
 
 		 414 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  47.37 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  47.37 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.35 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.09 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.93 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1674  ribosomal L11 methyltransferase  50.82 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.75 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  40 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  40 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  40 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.14 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.56 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.35 
 
 		 295 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.86 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 316 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  32.35 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  35.29 
 
 		 364 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 		 305 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 		 300 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  35.06 
 
 		 268 aa  51.6  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 		 300 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>