More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1263 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  959    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  58.84 
 
 
469 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  60.44 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  50.43 
 
 
466 aa  498  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  52.3 
 
 
472 aa  498  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  43.59 
 
 
634 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  43.87 
 
 
633 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  35.97 
 
 
512 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  33.74 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.25 
 
 
580 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  35.48 
 
 
491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  35.34 
 
 
503 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  34.93 
 
 
502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  35.43 
 
 
614 aa  255  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  35.5 
 
 
588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  32.97 
 
 
594 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  32.9 
 
 
592 aa  231  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  32.9 
 
 
594 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  30.3 
 
 
667 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  33.19 
 
 
879 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.04 
 
 
878 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.48 
 
 
880 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  27.88 
 
 
796 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.43 
 
 
885 aa  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  31.06 
 
 
896 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  24.94 
 
 
428 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.71 
 
 
428 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.47 
 
 
428 aa  167  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  24.52 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.97 
 
 
421 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  23.86 
 
 
441 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.8 
 
 
723 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.8 
 
 
784 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.55 
 
 
755 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.72 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  27.98 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.06 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.07 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.25 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  24.75 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  29.29 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.11 
 
 
243 aa  67  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.74 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  27 
 
 
496 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.64 
 
 
220 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.73 
 
 
235 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.67 
 
 
267 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  29.47 
 
 
551 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  25.7 
 
 
566 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.89 
 
 
248 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2405  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.99 
 
 
317 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.21 
 
 
268 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.18 
 
 
241 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  30.86 
 
 
227 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.82 
 
 
237 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2430  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.05 
 
 
300 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.09 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.7 
 
 
234 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.09 
 
 
256 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  25.18 
 
 
507 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4655  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.99 
 
 
316 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578959  hitchhiker  0.000501394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4332  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.19 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.7 
 
 
261 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1792  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.99 
 
 
310 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0381557  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.41 
 
 
234 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1930  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.99 
 
 
310 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.222487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1500  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.78 
 
 
319 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.635643  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1501  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.54 
 
 
249 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178392  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
237 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26 
 
 
244 aa  60.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  23.22 
 
 
234 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.22 
 
 
234 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.42 
 
 
264 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2616  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.8 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.882499  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.56 
 
 
234 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.29 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.3 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.7 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000664267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3123  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.64 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.478568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2430  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.64 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.15 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.96 
 
 
233 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1765  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.67 
 
 
226 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.79 
 
 
234 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2773  sulfate adenylyltransferase, small subunit  26.41 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31 
 
 
276 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.77 
 
 
273 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.04 
 
 
226 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2787  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.06 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000250358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.04 
 
 
226 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2459  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.17 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.79 
 
 
229 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.69 
 
 
234 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2336  sulfate adenylyltransferase subunit 2  30.28 
 
 
318 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.47 
 
 
246 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  25.2 
 
 
518 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  23.04 
 
 
234 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.33 
 
 
234 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3168  sulfate adenylyltransferase, small subunit  26.2 
 
 
316 aa  57  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 
334 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>