35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2364 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  147  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  94.59 
 
 		 74 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  52.05 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  44.12 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  46.58 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  44.12 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  36.99 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  43.24 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  47.89 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  42.47 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  42.47 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  43.24 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  43.24 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  46.58 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  45.95 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  46.48 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  46.48 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  45.07 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  38.67 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  32.88 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  41.89 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  41.3 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  36.49 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  37.33 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  35.21 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  37.14 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  39.73 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  36.11 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  35.38 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  34.78 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  32.88 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  30.99 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>