More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1872 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  71.2 
 
 
256 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  63.14 
 
 
255 aa  342  4e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 
250 aa  308  8e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  57.03 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  54.62 
 
 
255 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  57.03 
 
 
276 aa  295  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  55.82 
 
 
250 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  54.84 
 
 
250 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  51.81 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  50.8 
 
 
253 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  50.6 
 
 
252 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  278  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  49.6 
 
 
253 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  52 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  52.42 
 
 
299 aa  269  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  49.6 
 
 
259 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  46.99 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  45.38 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  46.18 
 
 
254 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
272 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  46.25 
 
 
258 aa  228  8e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  45.73 
 
 
258 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  45.38 
 
 
261 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  45.42 
 
 
258 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
255 aa  221  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.34 
 
 
274 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  42.58 
 
 
274 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  42.57 
 
 
262 aa  208  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
262 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  40.08 
 
 
275 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 
262 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  41.04 
 
 
268 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  43.83 
 
 
254 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.04 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
257 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  44.03 
 
 
247 aa  192  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
259 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  41.42 
 
 
418 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 
268 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.08 
 
 
269 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
275 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
277 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  38.34 
 
 
250 aa  176  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  38.74 
 
 
250 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.72 
 
 
267 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  38.3 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  38.43 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.98 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
273 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.31 
 
 
268 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  36.6 
 
 
275 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  37.86 
 
 
249 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  37.55 
 
 
282 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.55 
 
 
409 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  34.77 
 
 
258 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
418 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  37.45 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.84 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.68 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  38.27 
 
 
266 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
266 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  38.82 
 
 
375 aa  165  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.4 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.4 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.45 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  35.8 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  36.47 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.45 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.11 
 
 
625 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
263 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  37.6 
 
 
278 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
293 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  36.97 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  37.71 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  37.97 
 
 
376 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.51 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  34.9 
 
 
271 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.56 
 
 
265 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.56 
 
 
265 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  38.89 
 
 
283 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 
271 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 
271 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 
264 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>