187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0352 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  60.1 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  41.33 
 
 
228 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  44.44 
 
 
221 aa  174  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  40.62 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  40.62 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  40.44 
 
 
228 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  41.78 
 
 
221 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  42.53 
 
 
225 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  42.92 
 
 
221 aa  162  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  39.46 
 
 
216 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  39.91 
 
 
232 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  40.27 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  35.71 
 
 
244 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  37.66 
 
 
249 aa  138  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  37.87 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  43.18 
 
 
216 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  37.63 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  36.61 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2010  PHP-like protein  35.61 
 
 
247 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0799075  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  34.65 
 
 
219 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  33.2 
 
 
297 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  36.41 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  33.59 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  37.56 
 
 
241 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  33.66 
 
 
219 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0648  phosphotransferase domain-containing protein  33.66 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2727  PHP domain protein  33.03 
 
 
329 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  38.46 
 
 
221 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  34.22 
 
 
226 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  32.88 
 
 
299 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  32.88 
 
 
299 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  32.87 
 
 
299 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1701  phosphotransferase domain-containing protein  33.93 
 
 
220 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  0.300647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  31.79 
 
 
640 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  31.48 
 
 
295 aa  98.6  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  30.77 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  36.53 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  35.68 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1139  PHP domain protein  34.78 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0400  PHP domain protein  29.02 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0668  phosphotransferase domain-containing protein  35.75 
 
 
304 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0776  PHP domain protein  31.84 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  31.34 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0474  PHP domain protein  31.77 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.373007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  29.76 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0932  hypothetical protein  31.15 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.011707  normal  0.0312995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  32.43 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  29.27 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  29.76 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1365  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1375  phosphotransferase domain-containing protein  29.56 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0580  PHP domain protein  30.12 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1261  phosphotransferase domain-containing protein  30.88 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0655  phosphotransferase domain-containing protein  26.87 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000906576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0533  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8507  PHP domain protein  26.63 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  0.0271187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2911  hypothetical protein  26.57 
 
 
504 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.563241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  28.06 
 
 
352 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  26.79 
 
 
407 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  29.3 
 
 
480 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2957  hypothetical protein  31.87 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1841  phosphotransferase domain-containing protein  29.94 
 
 
382 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  27.14 
 
 
331 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
259 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  23.9 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0145  PHP domain protein  29.41 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.250685  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2637  metal-dependent phosphoesterase (PHP family)- like protein  30.39 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  26.17 
 
 
460 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0129  PHP domain protein  28.82 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  28.3 
 
 
458 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1306  phosphotransferase domain-containing protein  25.74 
 
 
514 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2550  phosphotransferase domain-containing protein  30.6 
 
 
352 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.393848  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  29.6 
 
 
353 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
452 aa  55.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  38.61 
 
 
281 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1254  phosphoesterase PHP-like  30.12 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2469  hypothetical protein  26.97 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  38.37 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  39.22 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  26.97 
 
 
460 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1137  hypothetical protein  30.65 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.322631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  27.16 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2902  PHP domain protein  28.27 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  28.82 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  46.91 
 
 
293 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  41.67 
 
 
280 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0378  phosphotransferase domain-containing protein  26.36 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000646599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  24.24 
 
 
425 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
373 aa  52  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0133  PHP domain protein  28.24 
 
 
233 aa  52  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000141938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  31.32 
 
 
278 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  35.71 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  29.29 
 
 
403 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0099  PHP domain protein  27.65 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1594  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  29.81 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00274037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  29.63 
 
 
401 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2797  PHP domain protein  27.59 
 
 
369 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>