27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8507  PHP domain protein  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  0.0271187 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  24.04 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1177  hypothetical protein  25.11 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.289963  normal  0.0134976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  28.9 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  26.04 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  25.89 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  26.83 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  24.76 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  23.85 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  24.32 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  27.7 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  24.24 
 
 
216 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  24.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  24.26 
 
 
640 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  23.32 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  25.9 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0890  hypothetical protein  38.3 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.445222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  24.5 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  23.86 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0129  PHP domain protein  20.98 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  23.15 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0145  PHP domain protein  20.81 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.250685  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  24.12 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  22.89 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0655  phosphotransferase domain-containing protein  30.49 
 
 
213 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000906576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  36.84 
 
 
286 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>