35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2911 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1306  phosphotransferase domain-containing protein  68.58 
 
 
514 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2911  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1039    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.563241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1774  hypothetical protein  61.16 
 
 
501 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  27.94 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  26.32 
 
 
232 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
224 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0278  hypothetical protein  27.91 
 
 
219 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000490308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  28.57 
 
 
255 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  28.1 
 
 
267 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  30.61 
 
 
221 aa  60.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2632  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  27.62 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  28.9 
 
 
226 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  27.7 
 
 
244 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20030  PHP domain protein  27.43 
 
 
225 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  25.98 
 
 
212 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  24.02 
 
 
221 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  26.32 
 
 
225 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  29.59 
 
 
216 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  27.09 
 
 
216 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  28.57 
 
 
228 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  31.13 
 
 
228 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0134  PHP domain protein  33.11 
 
 
242 aa  53.5  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.185633  normal  0.956573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  28.24 
 
 
640 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  29 
 
 
219 aa  52  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2727  PHP domain protein  29.1 
 
 
329 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  29.67 
 
 
228 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  29.5 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  24.27 
 
 
297 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  29.77 
 
 
275 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0400  PHP domain protein  24.75 
 
 
225 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2902  PHP domain protein  28.27 
 
 
230 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>