107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_620 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  94.98 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0648  phosphotransferase domain-containing protein  93.61 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0400  PHP domain protein  39.49 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  39.3 
 
 		 264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  35.89 
 
 		 640 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  38.73 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2010  PHP-like protein  34.12 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0799075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  34.85 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  38.15 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  37.29 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  33.82 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  30.15 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  31.5 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  30.5 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  30.52 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  29.65 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  30.15 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  30.5 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  34.48 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0533  phosphotransferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1261  phosphotransferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1365  phosphotransferase domain-containing protein  32.99 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0655  phosphotransferase domain-containing protein  34.87 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000906576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1375  phosphotransferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000413596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  29.85 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0474  PHP domain protein  33.14 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.373007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  28.21 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0580  PHP domain protein  29.78 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  28.16 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  31.37 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  27.75 
 
 		 299 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  85.1  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  27.45 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  26.73 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  31.79 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  24.53 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  26.4 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0668  phosphotransferase domain-containing protein  25.23 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  26.85 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  23.72 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  28.24 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1701  phosphotransferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  0.300647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  23.7 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  25.97 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  24.64 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  24.64 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  23.94 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  27.85 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1139  PHP domain protein  25.44 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2637  metal-dependent phosphoesterase (PHP family)- like protein  22.58 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  29.05 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2911  hypothetical protein  29.5 
 
 		 504 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.563241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0776  PHP domain protein  24.89 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2727  PHP domain protein  23.94 
 
 		 329 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 302 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  23.36 
 
 		 306 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  29.09 
 
 		 2684 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  29.89 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  27.01 
 
 		 809 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  33.75 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  21.21 
 
 		 772 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  22.38 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  33.33 
 
 		 281 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  38.81 
 
 		 1181 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  22.41 
 
 		 816 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  28.57 
 
 		 1171 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  42.55 
 
 		 1165 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  35.71 
 
 		 1186 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  36.23 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  33.33 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2903  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  40 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000108995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  24.79 
 
 		 352 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  26.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  35.71 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 820 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1594  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  25.48 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00274037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 819 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  35.29 
 
 		 1165 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 816 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  40.91 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1137  hypothetical protein  23.26 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.322631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  40.62 
 
 		 279 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0571  PHP domain protein  29.49 
 
 		 298 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>