32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1808 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1808  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.712122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1596  biopolymer transport protein  46.67 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3561  sigma-70 factor  44.17 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.373178  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0537  sigma-70 factor  43.98 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1224  sigma-70 factor  43.18 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1230  adventurous gliding motility protein S  40.24 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.096115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  34.48 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2955  hypothetical protein  37.25 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0444  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4463  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.61 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.272834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4444  adventurous gliding motility protein S  26.95 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4308  adventurous gliding motility protein S  25.52 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4453  adventurous gliding motility protein S  25.16 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  24.18 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.18 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  24.36 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.36 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  24.36 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  28 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  23.18 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  25.17 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.18 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.18 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1807  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.71 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  23.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.8 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.88 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5124  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.85 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>