46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2984 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  51.46 
 
 
360 aa  358  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  48.25 
 
 
362 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  48.39 
 
 
351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  47.51 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  47.21 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  47.8 
 
 
346 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  47.35 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  46.04 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  46.63 
 
 
346 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  43.99 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  47.65 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  47.35 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  46.33 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  47.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  46.22 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  46.33 
 
 
346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  47.06 
 
 
346 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  47.37 
 
 
348 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  46.2 
 
 
343 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  47.37 
 
 
348 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  41.62 
 
 
366 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  44.02 
 
 
358 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  43.95 
 
 
345 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  43.31 
 
 
351 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  42.77 
 
 
343 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  41.86 
 
 
343 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  41.11 
 
 
347 aa  278  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  44.31 
 
 
343 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  44.71 
 
 
347 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  43.03 
 
 
349 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  32.72 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  35.41 
 
 
328 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.06 
 
 
371 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  29.25 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  30.49 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.32 
 
 
377 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  25.07 
 
 
366 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.07 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.33 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.56 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  20.9 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  25 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.62 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  20.54 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  23.89 
 
 
359 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>