50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03666 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1435  hypothetical protein  41.71 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000858133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2741  hypothetical protein  41.71 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000501753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1324  hypothetical protein  41.71 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000375255  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06493  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3437  hypothetical protein  43.08 
 
 
182 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  39.42 
 
 
181 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003277  hypothetical protein  39.7 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.921739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0420  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  38.07 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5499  hypothetical protein  34.13 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2750  hypothetical protein  34.04 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2776  hypothetical protein  38.3 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  decreased coverage  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2602  hypothetical protein  34.56 
 
 
195 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000348759  hitchhiker  0.000000414333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2789  hypothetical protein  34.47 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0745609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2862  protein of unknown function DUF925  33.67 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0358865  unclonable  0.00000000000145139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1370  hypothetical protein  31.9 
 
 
195 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.777318  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3542  hypothetical protein  28.44 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2669  hypothetical protein  33.64 
 
 
195 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0126952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1391  hypothetical protein  34.9 
 
 
217 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1333  hypothetical protein  32.98 
 
 
200 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00042166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1520  hypothetical protein  31.75 
 
 
235 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00822925  normal  0.544828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1489  hypothetical protein  33.17 
 
 
229 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1484  hypothetical protein  32.2 
 
 
229 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0297404  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  28.84 
 
 
188 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  28.84 
 
 
188 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1672  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  32.26 
 
 
197 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2002  hypothetical protein  27.88 
 
 
191 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2330  hypothetical protein  28.85 
 
 
189 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000027236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2043  hypothetical protein  29.81 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2246  hypothetical protein  27.88 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02919e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2001  hypothetical protein  27.88 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2248  hypothetical protein  29.25 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2218  hypothetical protein  27.4 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.177664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3125  hypothetical protein  28.92 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2062  hypothetical protein  27.4 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  31.12 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2200  hypothetical protein  28.92 
 
 
191 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.443855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2590  hypothetical protein  27.36 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00160082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0597  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  27.62 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0089  hypothetical protein  26.19 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  28.04 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  28.37 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1341  hypothetical protein  36.22 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267893  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  26.74 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1791  hypothetical protein  22.55 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  26.92 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  24.3 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>