28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03514 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  100 
 
 		 109 aa  220  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  60 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  57.14 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  57.14 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  49.04 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  50 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  47 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  46.3 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  45.54 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  46 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  42 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  34.26 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  34.26 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  34.26 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  34.26 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  34.26 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  34.26 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  32.35 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  32.95 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0845  hypothetical protein  32.38 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4955  hypothetical protein  40.43 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 76 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>